Trong khung cảnh hỗn loạn của Kyoto thế kỷ 15, khi chiến tranh Onin đang cận kề, một nhóm thảo khấu do kiếm khách lừng danh Hyoe lãnh đạo đã nổi dậy chống lại chế độ Mạc phủ mục nát. Đứng đầu chiến tuyến, Hyoe không chỉ phải đối mặt với binh lính triều đình mà còn phải chạm trán với kẻ thù nguy hiểm nhất: Doken – người bạn cũ từng vào sinh ra tử, nay trở thành đối thủ khốc liệt nhất.

Đang trốn chạy khỏi hàng loạt rắc rối, một cảnh sát tuyệt vọng nghĩ rằng anh đã thoát khỏi vụ tông xe bỏ chạy. Nhưng có một nhân chứng và người đó có số điện thoại của anh.

Vào một buổi tối mưa, sinh viên đại học 19 tuổi Saeki Fumi tình cờ gặp cô bé 9 tuổi Kanai Sarasa đang ướt sũng trong công viên. Cô bé bị tách khỏi cha mẹ và sống với dì của mình, nhưng cô bé nói với Fumi rằng mình không muốn quay lại sống tiếp với bà ấy. Nhận thấy cô bé không muốn về nhà, Fumi quyết định đưa cô bé về chỗ của mình và họ sống cùng nhau. Hai tháng sau, Fumi bị bắt vì tội bắt cóc. Anh ấy bị coi là kẻ bắt cóc nguy hiểm và Sarasa được coi là nạn nhân đáng thương. 15 năm sau, Sarasa và...

Shin Godzilla 2016 bắt đầu từ khi Aqua Line của vịnh Tokyo bị lũ lụt và sụp đổ một cách bí ẩn, Phó Chánh văn phòng Nội Rando Yaguchi của Nhật Bản tin rằng vụ việc đã được gây ra bởi một sinh vật sống. Tuyên bố của ông khiến Thủ tướng Chính phủ cảm thấy không hài lòng và những giả định vụ tai nạn đã được gây ra bởi một thảm họa tự nhiên. Tuy nhiên những dấu hiệu từ vụ thiên tai không giống với bình thường