Snake Eyes: G.I. Joe Origins theo chân Snake Eyes - một chiến binh cô độc, ngoan cường bất ngờ được kết nạp vào gia tộc Arashikage sau khi cứu mạng người thừa kế của họ. Khi đến Nhật Bản, Arashikage dạy Snake Eyes những chiêu thức cơ bản của một chiến binh ninja đồng thời mang tới cho anh một mái ấm. Tuy nhiên, khi những bí mật từ quá khứ của Snake Eyes được bật mí, anh sẽ phải đối mặt với những thử thách lớn nhất trong cuộc đời.

Sau khi cứu người thừa kế của người thừa kế, đôi mắt cô độc ngoan cường của họ được chào đón thành một bang hội Nhật Bản cổ đại được gọi là Arashikage, nơi anh ta được dạy cách thức của Chiến binh Ninja. Nhưng, khi những bí mật từ quá khứ của anh ta được tiết lộ, mắt rắn 'vinh dự và lòng trung thành sẽ được thử nghiệm - ngay cả khi điều đó có nghĩa là mất niềm tin của những người gần gũi nhất với anh ta.

Một phụ nữ trẻ cô đơn ham mê một trò chơi thực tế ảo kết thân với một cô nàng tiệc tùng, người dẫn cô vào thế giới với những cảm giác mạnh mới lạ và những bí mật đen tối